Впервые ведомственный финансовый контроль в уголовно-исполнительной системе Ярославской области был организован в 1998 году путем создания контрольно-ревизионной группы.

В Управлении Федеральной службы исполнения наказаний по Ярославской области состоялось заседание коллегии по итогам оперативно-служебной, производственно-хозяйственной и финансово-экономической деятельности за 9 месяцев 2021 года.

Первые подразделения по работе с личным составом были созданы 28 февраля 1924 года в соответствии с Приказом ОГПУ «О реформировании юридических отделов ОГПУ и учреждении при Коллегии должности «особоуполномоченного».